高通量测序,又称下一代测序,其核心特点是能一次对几十万到几百万条DNA分子进行并行测序,这使得我们能够以前所未有的规模和速度分析基因组、转录组和表观基因组等。
以下是高通量测序主要包含的检测内容,可以分为几个大的层次:
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检测层次 |
技术名称 |
核心检测内容 |
主要应用 |
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基因组 |
全基因组测序 (WGS) |
全部DNA序列 |
遗传病、癌症突变、进化 |
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全外显子组测序 (WES) |
所有外显子区域 |
高效发现编码区致病突变 |
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目标区域测序 |
特定基因Panel |
肿瘤分型、伴随诊断 |
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转录组 |
RNA-Seq |
全部转录的RNA |
基因表达、差异分析、新转录本 |
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单细胞RNA-Seq (scRNA-Seq) |
单个细胞的转录组 |
细胞异质性、发育、免疫 |
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表观遗传 |
ChIP-Seq |
蛋白-DNA相互作用位点 |
转录因子结合、组蛋白修饰 |
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ATAC-Seq |
染色质开放区域 |
鉴定调控元件(增强子/启动子) |
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DNA甲基化测序 |
DNA上的甲基化修饰 |
基因沉默、印迹、癌症 |
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其他 |
宏基因组测序 |
环境中的所有微生物基因组 |
微生物群落、病原体发现 |
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免疫组库测序 |
T/B细胞受体的多样性 |
免疫应答、免疫疗法 |